Cell：张元豪等团队重构癌症基因组认知：ecDNA驱动癌基因融会转录本发生，成为肿瘤进化的焦点引擎
- 基因融会
- 染色体外DNA （ecDNA）扩增
- 致癌调理
来历：iNature 2026-01-13 10:31
该研究注解ecDNA是在分歧癌症类型中发生和扩增癌基因融会转录物的首要平台。
染色体外DNA （ecDNA）扩增是人类癌症的要害驱动身分。
2026年1月7日，斯坦福年夜学张元豪（Howard Y. Chang）团队在Cell 在线颁发题为EcDNA-borne structural variants drive oncogenic fusion transcript amplification的研究论文，该研究注解ecDNA是在分歧癌症类型中发生和扩增癌基因融会转录物的首要平台。
经由过程对肿瘤样本和各类组织类型的癌细胞系的全基因组和转录组序列的综合阐发，该研究发此刻任何拷贝数改变中，ecDNAs具有最高的癌基因融会事务产生率。
存眷最多见的ecDNA融会热门，该研究发现长链非编码RNA基因PVT1的5 ‘端与外显子1毗连到分歧的3 ’伴侣的融会，可能经由过程SRSF1依靠的机制提高了RNA的不变性，并加强了MYC依靠的转录和癌细胞的存活。这些成果注解，在癌症中，ecDNA增进了基因组的不不变性和频仍的癌基因融会构成。
染色体外DNA（ecDNA）是兆碱基对巨细的环状片断，编码癌基因和其他有益在肿瘤顺应性的遗传元件，驱动癌基因扩增、肿瘤内遗传异质性、肿瘤快速进化和医治耐药性。在成人癌症类型中，17.1%的肿瘤中检测到ecDNA衍生扩增，在转移性肿瘤中频率增添，而且与较短的保存期相干。
ecDNA代表了基因组不不变的首要情势，经由过程非孟德尔遗传驱动基因组重排和快速选择以取得合适变异，致使患者预后不良。晚期和转移性肿瘤表示出ecDNA拷贝数和布局复杂性的增添，在ecDNA扩增的癌基因位点中，布局变异（SV）承担特别升高，强调了ecDNA驱动的基因组不不变性在侵袭性癌症进展中的感化。
文章模式图（图源自Cell ）
基因组重排——包罗易位、倒位、插入和缺掉——当分歧基因的片断异常地毗连在一路时，可以发生基因融会。基因融会是很多癌症的标记，但在正常组织中很少见。高SV负荷增进基因融会，致使启动子劫持或融会转录物构成，粉碎基因调控，驱动肿瘤产生。
有趣的是，多项研究注解，基因融会和分歧癌症类型的基因组扩增之间存在很强的联系关系。比来的证据注解，ecDNA和基因融会之间存在潜伏的联系，由于在ecDNA上发现了频频截断的基因。但是，ecDNA在驱动发生基因融会的SVs中的感化和其功能后果仍不清晰。
该研究系统地检测了与ecDNA相干的基因融会，证实了ecDNA驱动的基因组不不变性是人类癌症中致癌基因融会的首要来历。该研究进一步存眷最多见的ecDNA融会热门，浆细胞瘤变异易位1 (PVT1)，揭露ecDNA依靠性融会增进癌症致癌调理的潜伏机制。
参考动静：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)01422-9
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